Il New York Times conferma che nel 2011 un giudice federale ha contestato l'NSA confondendo più volte il tribunale che controlla la sua sorveglianza sul territorio americano. Tra i suoi programmi di spionaggio è stata inclusa la raccolta di decine di migliaia di e-mail all'interno degli Stati Uniti e altre comunicazioni su Internet di cittadini americani ogni anno. La sentenza di 85 pagine del giudice John D. Bates, allora alla guida della Corte sulla sorveglianza e l'intelligence esterna, parla di un programma che sistematicamente cerca i contenuti delle comunicazioni internazionali degli americani, senza mandato giudiziario, e in cerca di conversazioni su stranieri oggetto di sorveglianza. Il giornale newyorchese rivela che il giudice Bates aveva informato il giudice di un'azione premeditata di ostruzionismo da parte dei funzionari della NSA che il programma aveva scoperto che anche memorizzando messaggi privati tra cittadini all'interno del paese per tre anni. Il magistrato è giunto alla conclusione che l'opinione pubblica aveva violato la Costituzione. I problemi sarebbero dovuti a un atteggiamento premedistico da parte di un'esternamente notata in un tribunale che potrebbe aver nascosto alla corte il suo modus operandi.
Secondo il New York Times, tra il 2008 e il 2011 l'agenzia ha raccolto 56.000 e-mail annuali dai cittadini degli Stati Uniti.