Οι μεγαλύτερες διαφωνίες ως προς την υλοποίηση της οδηγίας αφορούν το επίπεδο των οριακών τιμών, δηλαδή το όριο των εκπομπών που έχει θέσει κάθε κράτος.
I forbindelse med gennemførelsen af direktivet er der da også store meningsforskelle vedrørende grænseværdierne, det vil sige det emissionsloft, der er fastsat for hvert land.