Näissä suuntaviivoissa vaaditaan jäsenvaltioilta sitoutumista ensinnäkin esittämään Natura 2000:n mukaisten suojelukohteiden luettelonsa mahdollisimman nopeasti, ja toiseksi sitoutumista myös siihen, ettei Natura 2000:n mukaisia suojelukohteita vahingoiteta niiden toimien toteuttamisen yhteydessä, jotka saavat yhteisrahoitusta rakennerahastoista.
Retningslinjerne kræver, at medlemsstaterne hurtigst muligt for det første forpligter sig til at fremlægge deres lister over steder, der skal beskyttes i henhold til Natur 2000, og at de for det andet også forpligter sig til ikke at forringe kvaliteten af de områder, der skal beskyttes i henhold til Natur 2000 under gennemførelsen af de aktiviteter, der medfinansieres af strukturfondene.