Preşedinţia cehă s-a ocupat cu seriozitate şi de o activitate legată de alegerea noului Parlament European, respectiv iniţierea procesului de desemnare a unei Comisii pentru următoarea legislatură 2009-2014.
Чешкото председателство възприе също така сериозен подход спрямо една задача, свързана с избора на настоящия нов Европейски парламент, а именно поставяне на началото на процеса на назначаване на Комисия за следващия законодателен период: 2009-2014 г.